A los 23 años, Fabio Maria Capitanucci gana el Concurso del Teatro Lirico Sperimentale di Spoleto y, desde 1999 hasta 2001, ingresa en la Accademia di Perfezionamento del Teatro alla Scala.
Desde 1999 es un invitado habitual en el Teatro alla Scala de Milán, donde debuta como Marcello en La Bohème, Cavalier Belfiore en Un giorno di regno, Sharpless en Madama Butterfly, Lescaut en Manon de Massenet y Guglielmo en Così fan tutte. Con los años, en el mismo teatro también interpreta Lucia di Lammermoor, Les Troyens, Il viaggio a Reims y Le nozze di Figaro.
A lo largo de su carrera ha cantado en muchos de los principales teatros italianos, europeos e internacionales: L’elisir d’amore en Barcelona, Bari, Florencia, París, Fráncfort, Múnich, Valencia, Roma, Londres, Madrid, Turín y Trapani; La Bohème en Génova, Dresde, Madrid, Verona, Stresa, Turín, Londres, Nueva York y Tokio; Le nozze di Figaro en Turín, Madrid, Viena, Palermo y Dresde; Madama Butterfly en Palermo, Barcelona y Dresde; Candide, Il viaggio a Reims y La vedova allegra en Génova; Roberto Devereux en Pamplona, Marsella y Múnich; Così fan tutte en Hamburgo, Génova y Rieti; Lucia di Lammermoor en Marsella, Turín, Múnich y Nueva York; Don Pasquale en Florencia, Génova y Miami; La Cenerentola en Barcelona y Dresde; Il barbiere di Siviglia en Viena, Glyndebourne, Londres, Florencia, Dresde, Berlín, Lausana, Palma de Mallorca, Palermo, Budapest, Hamburgo y Múnich; La Traviata en Viena, Turín y Múnich; Falstaff en Viena, Dresde, Milán y Montecarlo; Les Troyens en Londres y Milán; Linda di Chamounix en Barcelona; Il Pirata en Marsella; I Puritani en La Coruña y Madrid; Maria Stuarda en Montecarlo y Pagliacci en Melbourne; Lo sposo di tre e marito di nessuna en Florencia; La gazza ladra y Cublai, gran kan de’ Tartari en Viena.